Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HHLA1C9JL84 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms