Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms