Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms