Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms