Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR13D1-202ENST00000641530 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01837-205ENST00000635947 1557 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAPDHP72-203ENST00000638093 1602 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM6-208ENST00000506134 1398 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL10-201ENST00000290208 2013 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 POTEB-202ENST00000439682 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA12-202ENST00000556881 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSF2RA-205ENST00000381524 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099811.6-201ENST00000624554 1638 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139156.2-201ENST00000414059 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNOT4P1-201ENST00000417432 1199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016738.2-203ENST00000433012 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097358.1-201ENST00000438827 582 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078842.1-201ENST00000438969 553 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010746.1-201ENST00000442984 452 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245517.1-201ENST00000444224 1262 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms