Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms