Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms