Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms