Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms