Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms