Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms