Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNE4Q8N205 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms