Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms