Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKOR2Q2VWA4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKOR2Q2VWA4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms