Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTC1Q2NKJ3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTC1Q2NKJ3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms