Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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