Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HADHQ16836 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms