Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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