Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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