Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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