Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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