Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms