Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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