Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms