Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms