Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms