Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX3P78415 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms