Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms