Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PITPNBP48739 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms