Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRATP43155 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRATP43155 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRATP43155 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms