Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP8P40818 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP8P40818 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms