Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MLH1P40692 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MLH1P40692 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MLH1P40692 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLH1P40692 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms