Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms