Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms