Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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