Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms