Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms