Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZBED1O96006 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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