Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms