Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms