Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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