Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms