Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms