Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD1Q9UIS9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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