Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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