Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms