Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNA4Q9HCM2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms