Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms