Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms