Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCDQ92629 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms